Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms