Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FAM187BQ17R55 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms