Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FXNQ16595 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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FXNQ16595 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXNQ16595 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXNQ16595 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXNQ16595 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXNQ16595 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXNQ16595 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXNQ16595 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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