Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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SS18Q15532 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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SS18Q15532 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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SS18Q15532 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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SS18Q15532 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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SS18Q15532 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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SS18Q15532 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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SS18Q15532 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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SS18Q15532 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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SS18Q15532 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SS18Q15532 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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