Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARHGEF6Q15052 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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