Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CACNA1SQ13698 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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