Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN3Q13064 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN3Q13064 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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