Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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PTPN13Q12923 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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