Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
POLEQ07864 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
POLEQ07864 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
POLEQ07864 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms