Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN11Q06124 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms