Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms