Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPZ1P61923 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms