Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCCD1P59942 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms