Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJA9P57773 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GJA9P57773 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GJA9P57773 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GJA9P57773 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms