Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP9P55211 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CASP9P55211 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CASP9P55211 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms