Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HOXD12P35452 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HOXD12P35452 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms