Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF3P18847 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATF3P18847 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms