Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCL3L1P16619 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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