Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CREB1P16220 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CREB1P16220 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CREB1P16220 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms