Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf172C9J069 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms