Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NOTOA8MTQ0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms