Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E2F8A0AVK6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms