Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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COPS3Q9UNS2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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COPS3Q9UNS2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS3Q9UNS2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS3Q9UNS2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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