Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNA3Q9UI47 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms