Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DNAJB4Q9UDY4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms