Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
LINC00474Q9P2X8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms