Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHRF1Q9P1Y6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHRF1Q9P1Y6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms