Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRDM9Q9NQV7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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