Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms