Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AMBRA1Q9C0C7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms