Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SMIM3Q9BZL3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms