Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDAC8Q9BY41 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms