Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms