Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RNF17Q9BXT8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RNF17Q9BXT8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms