Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB11FIP5Q9BXF6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB11FIP5Q9BXF6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms