Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms