Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms