Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTXN3Q4LDR2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTXN3Q4LDR2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms