Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TTLL9Q3SXZ7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms