Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SGCBQ16585 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SGCBQ16585 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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