Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VAMP3Q15836 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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