Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIP4Q15650 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms