Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SCARF1Q14162 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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