Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CUL1Q13616 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms