Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC025580.1-201ENST00000559553 729 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CAMK2BQ13554 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms