Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ARPP21-217ENST00000436702 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC008686.1-201ENST00000586894 565 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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MKRN4PQ13434 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MKRN4PQ13434 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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