Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SP140Q13342 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SP140Q13342 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SP140Q13342 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SP140Q13342 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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