Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SGCGQ13326 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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