Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC10A2Q12908 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms