Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LMAN2Q12907 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms